Het onderzoek dat aan de IUR wordt uitgevoerd, valt onder het Onderzoeksinstituut. Dit onderzoekinstituut werkt interfacultair en heeft tot doel om het onderzoeksbeleid van de universiteit te ontwikkelen, het beleid uit te voeren en te coördineren binnen de faculteiten van de universiteit.

Taken

Het Onderzoekinstituut wordt belast met:

• de organisatie, integratie en coördinatie van het wetenschappelijk onderzoek  van de faculteiten,
• de bewaking van de kwaliteit van het wetenschappelijk onderzoek,
• de ontwikkeling van het strategisch onderzoeksbeleid van de faculteiten in samenwerking met het BaMa opleidingsbestuur,
• de opleiding van de promovendi.

Het onderzoekinstituut heeft voor de vervulling van haar taken de beschikking over de onderzoekcapaciteit van de faculteiten van de universiteit.

Het instituutsbestuur draagt zorg voor de organisatie en coördinatie van het onderzoek en is onder meer belast met:

• het eens in de vijf jaar opstellen van het onderzoeksprogramma van het instituut;
• het jaarlijks vaststellen van een werkplan voor het instituut;
• het in overleg met de leiding van de betrokken afdelingen van de faculteit voorbereiden van de uitvoering van het werkplan van het instituut;
• het in overleg met de leiding van de betrokken leerstoelgroepen van de faculteit doen uitvoeren van het werkplan van het instituut;
• het jaarlijks opstellen van een jaarverslag van het instituut.

Typologie van onderzoek

Onlangs zijn de types onderzoek die in de IUR plaatsvinden vastgelegd. Deze zijn:

• beleidsonderzoek (onder andere naar de islam in een minderheidssituatie, de status en functie van Imams in een niet-moslimland);
• juridisch onderzoek (naar o.a. Islam en mensenrechten, offerfestiviteiten tussen islamitische en Europese wetsverordeningen en de interpretatie van islamitische regels in niet-moslimlanden);
• institutioneel/organisatorisch onderzoek (naar o.a. het schoolsucces van kinderen met een islamitische achtergrond en de functie van moskeeën in Nederland);
• en geschiedkundig en kunstonderzoek (het artistieke gebruik van islamitische kalligrafie in Europa en relaties tussen Nederland en het Ottomaanse rijk);
• wetenschappelijk onderzoek (diverse onderzoeksthema’s binnen de leerstoelgroepen om de studenten  van de opleidingen van zowel de IUR als van de andere onderwijsinstellingen te ondersteunen)